Le Museo del Cuale est situé dans le marché artisanal de Puerto Vallarta, sur l'île de Cuale. Il a été ouvert en décembre 1978. En 2004, la propriété et la muséographie ont été maintenues et l'année suivante, le musée a rouvert ses portes avec une collection de l'ouest du Mexique, prêtée par les musées régionaux de Guadalajara, Colima et Michoacán. En 2015, l'ouragan "Patricia", qui a frappé l'ouest du Mexique, a inondé la petite île du même nom dans la la le musée est situé, bien que la structure architecturale de la Cuale n'a pas été endommagé, comme une mesure préventive la collection archéologique a été emballé et transporté au Musée régional de Guadalajara (MRG). Le mardi 19 juin 2018, le musée de l'Institut national d'anthropologie et d'histoire (INAH) a rouvert ses portes afin de le rendre à nouveau accessible au public local et au tourisme national et étranger visitant Puerto Vallarta.